澎湖縣垃圾處理概況
澎湖縣沒有設置垃圾焚化廠。澎湖縣是離島縣份，在過去，澎湖的垃圾主要以掩埋來處理，但是隨著時間，各個掩埋場漸漸飽和，而環保署又不准澎湖興建焚化爐，所以澎湖每天60公噸的垃圾只能跨海運送到高雄市，付費請高雄市代為焚化。高雄市市長陳菊提到，澎湖是個美麗的島嶼，有令仍讚嘆的風景與自然生態，為了要落實環保、保有澎湖的環境品質，高雄市政府會義不容辭代為處理跨海運送來的垃圾。

澎湖的垃圾一直依賴掩埋處理，然而，隨著工商業、觀光業的發展，所帶來的垃圾問題不斷使土地有限的澎湖縣在處理垃圾上遇到困境。澎湖縣政府推動的「全分選零廢棄」政策的內容包含垃圾源頭減量、資源分類回收、廚餘回收及社區、法人團體環保知能等的教育宣導及推動。至於垃圾處理設施則包括垃圾儲存、垃圾分選、乾燥減量、造粒成型等設施，主要針對澎湖縣每日所產生的垃圾經由一般資源回收管道後進入資源回收廠的分選設施，再將進廠的垃圾細分為「資源垃圾」、「非資源適燃物」及「非資源不適燃物」三大類，分選出的「資源垃圾」將再送入目前一般的資源回收體系。

地方基層建設：充實垃圾處理設施
1. 行政院環境保護署核定補助3800萬元，興建澎湖縣垃圾資源回收廠第1期工程，執行期程至100年5月31日完工。目前，正向行政院環境保護署積極爭取增設工程經費3,400萬元，包含垃圾轉運所需設備及二次公害防制設備，希望完成後可以有效解決澎湖縣垃圾轉運處理之問題。
2. 推動垃圾強制分類的政策，逐年訂定目標垃圾減量率及資源回收率。
3. 馬公市鎖管港掩埋場於97年2月封閉。為了妥善處理澎湖縣垃圾問題，行政院環保署訂定了「澎湖縣垃圾轉運外縣市垃圾焚化廠處理計畫」，將馬公市、湖西鄉及白沙鄉納入轉運，並加強宣導、查核垃圾強制分類及不落地工作。

金門縣垃圾處理概況
根據環保局資料，金門一天垃圾量約有60-70噸，其中，離島小金門一天約3噸，這些垃圾全在當地掩埋，大金門本島的垃圾一天約64噸，10噸的廚餘會再被利用、12噸的瓶罐等做資源回收、12噸在金門掩埋，30噸則運往高雄市焚化。

綠島
綠島的垃圾在過去皆採簡易掩埋方式處理。然而，隨著觀光旅遊業的發展，來綠島觀光的遊客人數不斷增加，使得全島垃圾量激增，髒亂隨處可見，不僅影響觀瞻、也易造成病媒滋生、破壞環境。尤其，遊客帶來大量的保特瓶、玻璃容器及免洗餐具，對掩埋場容量及環境容受力造成沉重的負荷。為了處理綠島的垃圾問題，行政院離島建設基金會於91年間補助綠島鄉公所進行衛生掩埋場改善工程，並由環保署輔導，建置掩埋作業、滲出水處理、地下水監測等污染防治設施及協助操作維護，使垃圾妥善處理率於93年底達到百分之百，有效改善環境衛生。不過，後續的維護及永續發展還是要靠所有人共同的努力。